2024年
《麻省理工科技评论》中国智能计算创新人物
2023年
上海市生物信息学会 青年卓越奖
国际合成生物学大赛 (iGEM) Tongji-Software 队 领队 获金奖
2022年
上海市优秀学术带头人
中国计算机学会（CCF）杰出会员
上海市"智慧工匠" AI赋能医药研发与制造大赛二等奖
2021年
微众银行 微众学者
国际合成生物学大赛 (iGEM) Tongji-Software 队 领队 获金奖
国际合成生物学大赛 (iGEM) Tongji-Software 队 领队 software track 全球 Best Software 奖
同济大学育才奖二等奖
2020年
华夏医学科技奖 三等奖 （排名第二）
中国发明协会 发明创新奖 二等奖 （排名第三，肿瘤的个体化精准治疗和检测应用）
同济大学“卓越科研育人”奖
上海市曙光人才
入选2020年中国生物信息学应用十大进展
国际合成生物学大赛 (iGEM) Tongji-Software 队 领队 获金奖
2019年
入选2019年中国生物信息学应用十大进展
国际合成生物学大赛 (iGEM) Tongji-Software 队 领队 获金奖
2018年
教育部“长江学者奖励计划”青年学者
药明康德生命化学研究奖
国际合成生物学大赛 (iGEM) Tongji-Software 队 领队 获金奖
2017年
吴文俊人工智能自然科学奖 三等奖
2016年
上海市启明星人才
同济大学育才奖二等奖
同济大学青年百人计划
2011年
上海市浦江人才